Hemocultivos contaminados: bundle para lograr proporciones aceptables / Blood cultures contaminated: bundle to achieve acceptable proportions

Introducción. El problema de la contaminación de los hemocultivos es muy frecuente en establecimientos de atención hospitalaria, da lugar a la administración de antibióticos innecesarios y prolonga la hospitalización. Objetivo principal. Aplicar un bundle para reducir la proporción de contaminación de hemocultivos. Objetivo secundario. Realizar una encuesta anónima para detectar oportunidades de mejora en la técnica de extracción de hemocultivos. Metodología. Diseño del estudio: Estudio cuasi experimental que evaluó la proporción de contaminación de hemocultivos antes y después de implementar un bundle propio. Se determinó la proporción basal de contaminación de hemocultivos (ene-jul 2022), se realizó la intervención (agosto 2022) y se estableció la proporción de contaminación post intervención (sep.-abril 2023). Intervención: Se analizó la estructura, procedimiento y conocimiento del personal mediante una encuesta propia para detectar áreas de mejora. Se capacitó, a los técnicos de laboratorio, sobre el procedimiento de la toma de muestra mediante una simulación utilizando un brazo artificial. Se diseñó un bundle de seis medidas, se adaptó el procedimiento de toma de hemocultivo y se capacitó al personal. Análisis estadístico. Se analizó la proporción de hemocultivos contaminados entre los periodos pre y post utilizando Chi2 y la relación entre la proporción del periodo pre y post vs la literatura (3.00% contaminación aceptable) utilizando test Z para una proporción. Se consideró un p<0.05 como estadísticamente significativa. Se utilizo el software Stata 8. Resultados. Durante el estudio se analizaron un total de 3,965 hemocultivos. De estos, 1,978 corresponden al periodo pre-intervención y 1,987 corresponden al periodo post intervención. Durante la pre-intervención se detectaron 61 hemocultivos contaminados (3.08% vs 3.00% bibliografía, p:0.5866) mientras que en la etapa post intervención fue de 30 hemocultivos contaminados (1.51% vs 3.00% bibliografía, p:0.0000). La proporción de hemocultivos contaminados se redujo a la mitad, 3.08% vs 1.51%, p: 0.001. Se realizó una encuesta anónima pre y post intervención logrando mejoras en la técnica de toma de hemocultivos. Conclusión. La implementación del bundle propio para la extracción de hemocultivos, permitió reducir la proporción de contaminación a la mitad. El análisis de la encuesta nos permitió identificar oportunidades de mejora en la técnica de recolección de muestra de hemocultivos

Introduction: Contamination of blood cultures is very common in hospital care settings and results in the administration of unnecessary antibiotics and prolongs hospitalization. Main goal: Apply a bundle to reduce the rate of contamination of blood cultures. Secondary objective: Conduct an anonymous survey to detect opportunities for improvement in the blood culture extraction technique. Methodology: Study design: Quasi-experimental study that evaluated the proportion of blood culture contamination before and after implementing its own bundle. The baseline proportion of blood culture contamination was determined (Jan-July 2022), the intervention was performed (August 2022) and the post-intervention contamination proportion was established (September-April 2023). Intervention: The structure, procedure and knowledge of the staff was analyzed through an own survey to detect areas for improvement. Laboratory technicians were trained on the sample collection procedure through a simulation using an artificial arm. A bundle of six measures was designed: (hand hygiene with alcohol gel, use of common gloves and sterile gloves during extraction, antisepsis with alcoholic chlorhexidine gluconate, marking of the blood culture bottle up to the filling level, disinfection of the bottle cap). blood culture bottle with 70% alcohol, safety-lok kit with vacuum extraction system). The procedure was adapted and staff trained. Statistic analysis: The proportion of contaminated blood cultures between the pre and post periods was analyzed using Chi2 and the relationship between the proportion of the pre and post period vs the literature (3.00% acceptable contamination) using Z test for a proportion. P<0.05 was considered statistically significant. Stata 8 software was used.Results: A total of 3,965 blood cultures were analyzed during the study. Of these, 1,978 correspond to the pre-intervention period and 1,987 correspond to the post-intervention period. During the pre-intervention, 61 contaminated blood cultures were detected (3.08%) while in the post-intervention stage there were 30 contaminated blood cultures (1.51%). The proportion of contaminated blood cultures was reduced by half, 3.08% vs 1.51%, p: 0.001. An anonymous survey was carried out pre and post intervention, achieving improvements in the technique of taking blood cultures. Conclusion: The implementation of the own bundle for the extraction of blood cultures allowed the contamination rate to be reduced by ha

Hiperplasia pseudoepiteliomatosa: carcinoma escamocelular versus paracoccidioidomicosis oral, un caso con mirada dermatológica / Pseudoepitheliomatous hyperplasia: Squamous cell carcinoma versus oral paracoccidioidomycosis, a case from a dermatological perspective

La paracoccidioidomicosis es una micosis sistémica endémica en Latinoamérica. La presentación más frecuente compromete crónicamente los pulmones, la piel y las mucosas. Al inicio, este paciente presentó, por varios años, una lesión única en la mucosa oral que, en ausencia de otros síntomas, se relacionó con una neoplasia maligna, específicamente con un carcinoma escamocelular. La diferenciación entre los dos diagnósticos se hace mediante un examen directo, un estudio histopatológico y cultivos iniciales y subsecuentes. Sin embargo, tales estudios no fueron concluyentes. Después de varias consultas y pruebas, con los resultados del examen directo, la inmunodifusión y la PCR en tiempo real se confirmó el diagnóstico de paracoccidioidomicosis crónica multifocal. Este caso alerta sobre la ausencia de sospecha clínica de micosis endémicas, dada la presencia de lesiones mucocutaneas que pueden ser producidas por hongos como Paracoccidioides spp, y la importancia de considerarlas entre los diagnósticos diferenciales.

Paracoccidioidomycosis is a systemic mycosis endemic in Latin America. The most frequent form involves a chronic compromise of the lungs, skin, and mucosa. The patient started with a single oral lesion that lasted for several years. The absence of other symptoms pointed out a possible malignant neoplasm, specifically a squamous cell carcinoma. Differentiation between both diagnoses-fungal infection and carcinoma-depends on the results of the direct examination, the histopathological study, and the initial and subsequent cultures. However, in this case, those findings were not conclusive. The coexistence of both diagnoses is frequent and increases the diagnostic challenge. After several consultations and tests, direct examination, immunodiffusion and real-time PCR findings the multifocal chronic paracoccidioidomycosis diagnosis was confirmed. This case warns about a systematical absence of clinical suspicion of endemic mycoses before the appereance of mucocutaneous lesions, which can be produced by fungi like Paracoccidioides spp, and the importance of considering those mycoses among the differential diagnoses.

Dengue como fenómeno epidemiológico emergente: dinámica de los brotes en la provincia de Buenos Aires en 2016 Y 2020 / Dengue as an emergent epidemiological phenomenon: dynamics of the outbreaks of 2016 and 2020 in Buenos Aires province

RESUMEN INTRODUCCIÓN: El dengue constituye un problema emergente en Argentina. En la provincia de Buenos Aires se inició un primer brote en 2016, y el de 2020 registró un 82% más de casos y afectó municipios sin antecedentes previos. El objetivo de este estudio fue caracterizar la dinámica de los brotes bonaerenses de 2016 y 2020 . MÉTODOS: Se realizó un estudio descriptivo, retrospectivo y transversal. Los casos fueron registrados en el Sistema Nacional de Vigilancia de la Salud. Fueron calculadas las distribuciones de frecuencia de los casos notificados, considerando también el origen: importados o autóctonos. Las tasas de incidencia y las razones de tasas se calcularon por Región Sanitaria. La difusión de la onda epidémica para ambos brotes fue obtenida mediante el cálculo de métricas adimensionales . RESULTADOS: Ambos brotes manifestaron ondas de similar comportamiento, pero con diferente expansión temporal y velocidades de difusión que se distanciaron en el inicio y luego hacia el final, presentando el último brote una mayor incidencia pero con una tasa de propagación de menor variación . DISCUSIÓN: La investigación realizada permitió caracterizar los brotes ocurridos en 2016 y 2020, y focalizar regionalmente la incidencia del fenómeno reemergente de la infección por arbovirus dengue (principalmente DEN-1 circulante) en la provincia de Buenos Aires, con cifras de incidencia que superaron lo conocido en la historia de la enfermedad en Argentina.

ABSTRACT INTRODUCTION: Dengue is an emerging problem in Argentina. In the province of Buenos Aires, the first outbreak was in 2016, and the one occurred during 2020 caused 82% more cases and affected districts with no previous cases. The objective of this study was to characterize the outbreak dynamics in the province of Buenos Aires in 2016 and 2020 . METHODS: A descriptive, retrospective and crosssectional study was conducted. The cases were registered in the National Health Surveillance System. The frequency distributions of the reported cases were calculated, considering also the origin: imported or autochthonous. Incidence rates and rate ratios were calculated for each Health Region. The diffusion of the epidemic wave for both outbreaks was obtained by calculating dimensionless metrics . RESULTS: Both outbreaks showed waves with similar behavior, but with different temporal expansion and diffusion speeds that distanced from each other at the beginning and then towards the end. The last outbreak had a higher incidence, but a propagation rate with less variation . DISCUSSION: This research allowed to characterize the two outbreaks occurred in 2016 and 2020, and to focus regionally on the incidence of the re-emerging phenomenon of dengue arbovirus infection (mainly circulating DEN-1) in the province of Buenos Aires, with incidence figures that exceeded those known in the history of the disease in Argentina.

Seropositividad a Chlamydophila psittaci en cotorras argentinas (Myiopsitta monachus) invasoras de la ciudad de Santiago de Chile

Introducción: Chlamydophila psittaci es una bacteria zoonótica e intracelular estricta, que provoca la psitacosis humana y su principal hospedero son las aves psitácidas. La cotorra argentina es un ave psitácida nativa de Sudamérica y actualmente considerada una especie invasora en 19 países, incluyendo Chile. Objetivo: Determinar positividad contra C. psittaci en muestras de suero y torulados de cotorras argentinas de vida libre capturadas en la Región Metropolitana de Chile. Métodos: Se analizaron 95 muestras de suero de pichones e individuos adultos de cotorras argentinas, a través de una prueba de ELISA indirecto utilizando un kit comercial. Posteriormente, se analizaron 40 tórulas nasotraqueales y cloacales de individuos adultos a través de una RPC en tiempo real específica para C. psittaci. Resultados: Se detectaron anticuerpos en muestras de suero de cinco individuos adultos de cotorras argentinas (n = 68), mientras que ninguno de los pichones analizados fue seropositivo (n = 27). Todas las muestras analizadas a través de RPC en tiempo real fueron negativas. Conclusión: Estos resultados demuestran por primera vez en Chile la exposición a C. psittaci en cotorras argentinas de vida libre, lo cual puede representar un riesgo importante para la transmisión de este patógeno a poblaciones humanas y animales.

Background: Chlamydophila psittaci is a zoonotic obligate intracellular bacterium that causes the human psittacosis, and its main host are psittacine birds. The monk parakeet is a psittacine bird native to South America, currently being considered an invasive species in 19 countries, including Chile. Aim: To determine positivity to C. psittaci in serum samples and swabs from free-ranging monk parakeets captured in the Metropolitan Region of Chile. Methods: Ninety-five serum samples from nestling chicks and adult monk parakeets were tested using an indirect ELISA test kit. Cloacal and nasotracheal swabs from 40 adult parakeets were further analyzed by C. psittaci-specific real-time PCR. Results: We found antibody titers in sera of five adult monk parakeets (n = 68) while none of the nestlings were seropositive (n = 27). All samples tested with real-time PCR were negative. Conclusions: Our results demónstrate for the first time in Chile the exposure to C. psittaci in free-ranging monk parakeets which may represent a significant risk of pathogen transmission to human and animal populations.

Estimating the economic impact of interpersonal violence in Mexico in 2021: projecting three hypothetical scenarios for 2030 / Estimación del impacto económico de la violencia interpersonal en México en el 2021: proyección de tres escenarios hipotéticos para el 2030 / Estimativa do impacto econômico da violência interpessoal no México em 2021: projeção de três cenários hipotéticos para 2030

ABSTRACT Objective. To calculate the economic impact of violence across Mexico in 2021 and project costs for 2021-2030. Methods. Incidence data was obtained from the Executive Secretariat of the National Public Security System, (SESNSP), National Population Council (CONAPO), National Institute of Statistics and Geography (INEGI), and the National Survey of Victimization and Perception of Public Safety (ENVIPE). Our model incorporates incidence estimates of the costs of events associated with violence (e.g., homicides, hospitalizations, rapes, extortions, robbery, etc). Results. The economic impact of crime and violence in Mexico for the year 2021 has been estimated at about $192 billion US dollars, which corresponds to 14.6% of the national GDP. By reducing violence 50% by 2030, we estimate savings of at least US$110 billion dollars. This represents a saving of US$1 376 372 for each company and more than US$66 771 for each Mexican. Conclusion. Violence and homicides have become one of the most pressing public health and economic concerns for their effect on health, development, and economic growth. Due to low cost and high impact, prevention is the most efficient way to respond to crime and violence while also being an essential component of sustainable strategies aimed at improving citizen security.

RESUMEN Objetivo. Calcular el impacto económico de la violencia en el 2021 en todo México y proyectar sus costos para el período 2021-2030. Métodos. Los datos de incidencia se obtuvieron del Secretariado Ejecutivo del Sistema Nacional de Seguridad Pública (SESNSP), el Consejo Nacional de Población (CONAPO), el Instituto Nacional de Estadística y Geografía (INEGI), y la Encuesta Nacional de Victimización y Percepción sobre Seguridad Pública (ENVIPE). Nuestro modelo incorpora estimaciones de la incidencia de los costos de los eventos asociados a la violencia (por ejemplo, homicidios, hospitalizaciones, violaciones, extorsiones, robos, etc.) Resultados. Se ha estimado que el impacto económico del delito y la violencia en México para el año 2021 es de alrededor de US$ 192 000 millones de dólares estadounidenses, lo que corresponde al 14,6% del PIB nacional. Estimamos que una reducción del 50% de la violencia para el 2030 supondría un ahorro de al menos US$110 000 millones. Esto representa un ahorro de US$1 376 372 para cada empresa y de más de US$66 771 para cada mexicano. Conclusión. La violencia y los homicidios se han convertido en una de las preocupaciones económicas y de salud pública más apremiantes por su efecto sobre la salud, el desarrollo y el crecimiento económico. Debido a su bajo costo y alto impacto, la prevención es la forma más eficiente de responder al delito y la violencia, al tiempo que es un componente esencial de las estrategias sostenibles dirigidas a mejorar la seguridad ciudadana.

RESUMO Objetivo. Estimar o impacto econômico da violência no México em 2021 e fazer a projeção de custos para o período 2021-2030. Métodos. Os dados de incidência da violência no país foram obtidos da Secretaria Executiva do Sistema Nacional de Segurança Pública (SESNSP), do Conselho Nacional de População (CONAPO), do Instituto Nacional de Estatística e Geografia (INEGI) e da Pesquisa Nacional de Vitimização e Percepção de Segurança Pública (ENVIPE). O modelo incorpora estimativas de incidência de custos de eventos associados à violência (como homicídios, internações hospitalares, estupros, extorsões e roubos). Resultados. O impacto econômico da criminalidade e da violência no México foi estimado em torno de US$192 bilhões em 2021, o que equivale a 14,6% do produto interno bruto (PIB) nacional. Estima-se que reduzir a violência em 50% até 2030 pode resultar em uma economia de US$ 110 bilhões ou mais, o que representa uma redução de gastos de US$1 376 372 para cada empresa e de mais de US$66 771 para cada cidadão do México. Conclusão. A violência e os homicídios são um dos problemas econômicos e de saúde pública mais prementes por suas consequências à saúde, ao desenvolvimento e ao crescimento econômico do país. Devido ao seu baixo custo e alto impacto, a prevenção é a forma mais eficiente de combater a criminalidade e a violência, além de ser um componente essencial de qualquer estratégia sustentável para aumentar a segurança da população.

Caracterización y biomonitoreo de contaminantes orgánicos e inorgánicos en una zona ladrillera de San Luis Potosí / Characterization and biomonitoring of organic and inorganic contaminants in a brick-making area of San Luis Potosí

Resumen El sector ladrillero se caracteriza por la elaboración del ladrillo de forma artesanal donde utilizan técnicas rudimentarias, hornos de baja tecnología y diversos combustibles de poca calidad generando humos negros con gran cantidad de contaminantes. Por lo que el objetivo de este estudio fue caracterizar los metales en suelo, HAPs en aire y biomonitoreo de HAPs en trabajadores de la zona ladrillera "Las Terceras" San Luis Potosí, México. Con el fin de conocer la exposición laboral se determinó la concentración de HAPs en partículas PM10, se caracterizó el suelo de la zona de trabajo y se realizó un biomonitoreo de me-tabolitos hidroxilados HAPs (OH-HAPs) en orina de los trabajadores. En aire se encontraron 14 de los 16 HAPs prioritarios por la Agencia de Protección Ambiental en la fracción de PM10, con una concentración media de 5293,05 gg/m3 (3,11-10510,81). Los resultados del análisis químico de los polvos mostraron que están constituidos principalmente de cuarzo (SiO2) y arcillas (SiAlOx) con presencia de óxidos de Fe-Ti, fosfatos de tierras raras (Lantano, Cerio, Neodimio Torio), silicatos de zirconio, sulfatos de bario, óxidos de zinc. En el biomonitoreo participaron 42 trabajadores ladrilleros, los resultados de la exposición a OH-HAPs en orina demostraron la media total de los OH-HAPs de 15,7 (6,92-195) ng/ml. Estos resultados muestran que el monitoreo ocupa-cional de las zonas ladrilleras es importante debido al escenario de riesgo y a las condiciones precarias de este trabajo, además de la alta exposición a contaminantes que afectan la salud de los trabajadores y sus familias, así como la propuesta de estrategias que ayuden a minimizar los impactos ambientales y prevenir los efectos en salud de las poblaciones.

Abstract The brick-making sector is characterized by artisanal brick production using rudimentary techniques, low-tech kilns and various low-quality fuels that generate black fumes with a large amount of pollutants. Therefore, the objective of this study was to characterize metals in soil, PAHs in air and biomonitoring of PAHs in workers of the "Las Terceras" brick area in San Luis Potosí, Mexico. In order to know the occupational exposure, the concentration of PAHs in PM10 particles was determined, the soil of the work area was characterized and a biomonitoring of hydroxylated PAH metabolites (OH-HAPs) in the urine of the workers was carried out. In air, 14 of the 16 PAHs prioritized by the Environmental Protection Agency were found in the PM10 fraction, with an average concentration of 5293.05 gg/m3 (3.11-10510.81). The results of the chemical analysis of the dusts showed that they are mainly constituted of quartz (SiO2) and clays (SiAlOx) with presence of Fe-Ti oxides, rare earth phosphates (Lanthanum, Cerium, Neodymium Thorium), zirconium silicates, barium sulfates, zinc oxides. The biomonitoring involved 42 brick workers, the results of OH-HAPs exposure in urine showed the mean total OH-HAPs of 15.7 (6.92-195) ng/ml. These results show that occupational moni-toring of brick-making areas is important due to the risk scenario and the precarious conditions of this work, in addition to the high exposure to pollutants that affect the health of workers and their families, as well as the proposal of strategies that help minimize environmental impacts and prevent health effects on populations.

Incidencia de flebitis en pacientes pediátricos con catéter periférico en una institución de Manizales / Incidence of phlebitis in patients with peripheral catheter in a health care institution in Manizales (Colombia)

Introducción: El cuidado de enfermería en áreas clínicas requiere conocimiento, habilidad y experiencia. El tratamiento de una persona hospitalizada usualmente necesita un acceso venoso, en este procedimiento pueden presentarse complicaciones, siendo la flebitis e infiltración las principalmente reportadas. Objetivo: Determinar la incidencia de flebitis en pacientes pediátricos con catéter corto periférico de acuerdo con el grado de la misma y diversos factores implicados en su aparición. Materiales y métodos: Estudio cuantitativo, prospectivo, observacional y documental realizado entre octubre 2018 a febrero 2019. Resultados: Se encontró una tasa de incidencia de flebitis de 18,5%. De 849 niños con catéter venoso periférico, 157 reportaron flebitis; de ellos 52,2% presentaron flebitis grado I; 29,9%, grado II; 15,3% grado III y 2,5% grado IV. El 78% de los niños presentó peso y talla adecuados para la edad. La flebitis identificada se relacionó al catéter preventivo y asociado a medicamentos como cefalotina y dipirona, así como la presentación en la etapa de infancia y adolescencia de flebitis grado I. Conclusiones: La identificación de la flebitis, sus grados y correlación con las variables sociodemográficas y clínicas, permiten establecer acciones de cuidado y fomento de estrategias para mejorar la atención y los estándares de alta calidad.

Introduction: Nursing care in clinical areas requires knowledge, skills, and experience. Treatment of a hospitalized person usually requires venous access, which carries frequently reported complications such as phlebitis and infiltrations. Objective: To determine the incidence of phlebitis in patients with short peripheral catheter according to its grade and various factors involved in its appearance. Materials and methods: Quantitative, prospective, observational, and documentary study carried out between October 2018 and February 2019. Results: An incidence rate of phlebitis of 18.5% was observed. Phlebitis was reported in 157 out of 849 children with peripheral venous catheter. Grade I, II, III, and IV phlebitis was documented in 52.2%, 29.9%, 15.3%, and 2.5%. respectively. 78% of the children showed adequate weight and height for their age group. These cases of phlebitis were related to preventive catheter and associated with the use of medications such as cephalothin and dipyrone. In the case of grade I phlebitis, it was more frequent in childhood and adolescent populations. Conclusions: The identification of phlebitis, its grades, and its correlation with sociodemographic variables is necessary to establish health care actions and promote strategies in order to improve care and achieve high quality standards.

Enteroscopia de doble balón: experiencia inicial en un hospital universitario / Double balloon enteroscopy: Initial experience in a university hospital

Resumen Introducción: el estudio de intestino delgado es un desafío, motivo de avance médico y de interés. La enteroscopia de doble balón (EDB) permite una visualización directa del intestino delgado. Objetivo: describir indicaciones, características del procedimiento, hallazgos, complicaciones y seguimiento de pacientes llevados a EDB en el Hospital de San José de Bogotá, entre noviembre de 2011 y abril de 2019. Metodología: estudio de serie de casos. Se incluyeron pacientes con indicación clínica o por imágenes diagnósticas sugerentes de lesión a nivel de intestino delgado. Se empleó estadística descriptiva. Resultados: se realizaron 45 enteroscopias a 44 pacientes, con una mediana de edad de 58 años. La principal indicación fue hemorragia digestiva potencial de intestino delgado (53,3 %) y diarrea crónica (11,1 %); fueron más frecuentes los procedimientos por vía anterógrada. La mayoría de los resultados fue normal (46,7 %); entre los hallazgos más frecuentes estuvieron los tumores (11,1 %), enfermedad de Crohn (8,9 %) y úlceras/erosiones (6,7 %). El rendimiento diagnóstico fue 53,3 %, la correlación con la videocápsula endoscópica (VCE) fue 37,5 % y con estudios de imagen, 42,9 %. No se presentaron complicaciones. Se hizo seguimiento al 91,1 % de los pacientes con una mediana de 56 meses y se observó la resolución de síntomas en el 78,1 %. La finalidad de la enteroscopia fue diagnóstica en el 84,4 %. Conclusiones: La EDB es útil en la evaluación del intestino delgado con posibilidad terapéutica. Los resultados son similares a los reportados en la literatura mundial. Si se realiza seguimiento, se puede definir la necesidad de repetición del procedimiento, realización de estudios adicionales u observar resolución de los síntomas.

Abstract Introduction: The study of the small bowel is a challenging task that has sparked interest and progress in medicine. In this context, double balloon enteroscopy (DBE) has allowed the direct visualization of the small intestine. Objective: To describe indications, procedure characteristics, findings, complications, and follow-up of patients taken to DBE at the Hospital de San José, Bogotá, between November 2011 and April 2019. Methodology: Case series study. Patients with a clinical indication or diagnostic images suggestive of small bowel lesion were included. Descriptive statistics were used. Results: 45 enteroscopies were performed in 44 patients, with a median age of 58 years. The main indication was potential small bowel bleeding (53.3%) and chronic diarrhea (11.1%). Anterograde procedures were more frequent. Most of the results were normal (46.7%); tumors (11.1%), Crohn's disease (8.9%), and ulcers/erosions (6.7%) were among the most frequent findings. The diagnostic yield was 53.3% and the correlation with capsule endoscopy (CE) was 37.5%, and with imaging studies 42.9%. There were no complications. 91.1 % of patients were followed up on after a median of 56 months, with 78.1 % reporting symptom remission. The aim of enteroscopy was diagnostic in 84.4%. Conclusions: DBE is useful in the evaluation of the small intestine with a therapeutic possibility. The results are similar to those reported in the world literature. Follow-up can define the need for repeating the procedure, performing further studies, or symptom resolution.

Estudio multicéntrico argentino sobre la utilidad del panel de neumonía de FilmArray® / Argentine multicenter study on the utility of the FilmArray® pneumonia panel

Resumen Las infecciones de las vías respiratorias inferiores se encuentran entre aquellas en las que el uso inadecuado de antimicrobianos es frecuente, por lo que es fundamental contar con una prueba diagnóstica rápida, sensible y específica. El sistema de FilmArray es un análisis de PCR múltiple con un panel de neumonía que incluye 26 microorganismos y 7 marcadores de resistencia antimicrobiana. Los objetivos de este estudio fueron: a) establecer la correlación entre los cultivos cuantitativos para agentes bacterianos de muestras de vías respiratorias inferiores (MRVB) y la detección fenotípica de mecanismos de resistencia con los correspondientes resultados de FilmArray; b) determinar el cambio terapéutico generado con el informe del resultado inmediato. Se incluyó un total de 194 MRVB correspondientes a 191 pacientes con neumonía y se documentaron 277 bacterias. FilmArray identificó 253/277 (91%) bacterias y 161/277 (58%) se aislaron del cultivo, 58 (23%) coincidieron con el mismo recuento, 116 (46,7%) dieron mayores recuentos con FilmArray y 72 (28,9%) fueron detectadas por este método pero el cultivo fue negativo. Se detectaron marcadores de resistencia antimicrobiana en 63 aislados, pero solo 28 fueron confirmados por métodos fenotípicos. Estos resultados podrían haber provocado cambios en el tratamiento antibiótico en el 74,6% (174/194). FilmArray es una herramienta útil para optimizar el tratamiento antimicrobiano en pacientes con neumonía.

Abstract Lower respiratory tract infections are among those in which the inappropriate use of antimicrobials is common, so it is essential to have a rapid, sensitive and specific diagnostic test. The FilmArray system is a multiplex PCR assay with a pneumonia panel that includes 26 microorganisms and 7 antibiotic resistance markers. The objectives of this study were: a) to establish the correlation between quantitative cultures for bacterial agents from lower respiratory tract samples (MRVB) and the phenotypic detection of resistance mechanisms with the corresponding results of FilmArray b) to determine the therapeutic change generated with the immediate result report. A total of 194 MRVB corresponding to 191 patients with pneumonia were included and 277 bacterial strains were documented. FilmArray identified 253/277 (91%) bacteria and 161/277 (58%) were isolated from culture, 58 (23%) matched the same count, 116 (46.7%) yielded higher counts with FilmArray, and 72 (28.9%) with negative culture were detected by this method. Antibiotic resistance markers were detected in 63 strains, but only 28 were confirmed by phenotypic methods. These results may cause changes in the antimicrobial treatment in 74.6% (174/194). FilmArray is a useful tool to optimize antimicrobial therapy in patients with pneumonia.

Resumo As infecções do trato respiratório inferior estão entre aquelas em que o uso inadequado de antimicrobianos é comum, por isso é essencial um teste diagnóstico rápido, sensível e específico. O sistema FilmArray é um ensaio de PCR multiplo com um painel de pneumonia que inclui 26 microrganismos e 7 marcadores de resistência antimicrobiana. Os objetivos deste estudo foram: a) estabelecer a correlação entre as culturas quantitativas de agentes bacterianos de amostras do trato respiratório inferior (MRVB) e a detecção fenotípica de mecanismos de resistência com os resultados correspondentes do FilmArray b) determinar a alteração terapêutica gerada com o relatório de resultado imediato. Um total de 194 MRVB correspondendo a 191 pacientes com pneumonia foram incluídos e 277 cepas bacterianas foram documentadas. FilmArray identificou 253/277 (91%) bactérias e 161/277 (58%) foram isoladas da cultura, 58 (23%) coincidiram com mesma contagem, 116 (46,7%) deram contagens mais altas com FilmArray e 72 (28,9%) foram detectados por este método, mas a cultura foi negativa. Marcadores de resistência antimicrobiana foram detectados em 63 cepas, mas apenas 28 foram confirmados por métodos fenotípicos. Esses resultados puderam causar alterações no tratamento antibiótico em 74,6% (174/194). FilmArray é uma ferramenta útil para otimizar a terapia antimicrobiana em pacientes com pneumonia..

COVID-19 en terapia intensiva: ¿qué pacientes tienen más riesgo de requerir ventilación mecánica? / COVID-19 in intensive care: which patients are most at risk of requiring mechanical ventilation?

Introducción: En COVID-19 grave, identificar pacientes con mayor riesgo de ventilación mecánica (VM) ayuda a optimizar el manejo. Materiales y métodos: Análisis retrospectivo de características clínico-epidemiológicas de pacientes con COVID-19 ingresados a UTI entre marzo/septiembre 2020. Se utilizó estadística descriptiva, análisis univariado (p significativa <0.05) y multivariado (variables significativas en el univariado).Resultados: Ingresaron 114 pacientes, 91 (79,8%) hombres, edad promedio 54,6 ±14,8 años. 66 (57,9%) eran obesos, 44 (38,6%) ≥ 60 años, 38 (33,3%) hipertensos (33,3%) y 28 (24,6%) diabéticos. 39 (23%) tenían ferritina elevada, 62 (76,5%) linfopenia y 33 (41,3%) LDH aumentada. Mortalidad global 34%. 72 pacientes (63,1%) requirieron VM. Los predictores independientes de requerimiento de VM en el análisis multivariado fueron sexo masculino, edad ≥60 años, diabetes, linfopenia y ferritina y LDH aumentadas. Conclusiones: En pacientes con COVID-19 grave, los predictores independientes de necesidad de VM fueron sexo masculino, edad ≥ 60 años, diabetes, niveles elevados de ferritina y LDH y linfopenia

Introduction: In severe COVID-19, identifying patients with a higher risk of mechanical ventilation (MV) helps to optimize management.Materials and methods: Retrospective analysis of clinical-epidemiological characteristics of patients with COVID-19 admitted to ICU between March / September 2020. Descriptive statistics, univariate and multivariate analysis were used. Results: 114 patients were admitted, 91 (79.8%) were men, mean age 54.6 ± 14.8 years. 66 (57.9%) were obese, 44 (38.6%) ≥60 years, 38 (33.3%) were hypertensive (33.3%) and 28 (24.6 %) diabetics. 39 (23%) had elevated ferritin, 62 (76.5%) had lymphopenia, and 33 (41.3%) had increased LDH. Overall mortality 34%. 72 patients (63.1%) required MV. The independent predictors of MV requirement in the multivariate analysis were male sex, age ≥60 years, diabetes, lymphopenia, and increased ferritin and LDH.Conclusions: In patients with severe COVID-19, the independent predictors of the need for MV were male sex, age ≥ 60 years, diabetes, elevated levels of ferritin and LDH, and lymphopenia

Infecciones fúngicas en pacientes con COVID-19 / Fungal infections in patients with COVID-19

En diciembre de 2019 se identificó en Wuhan, China, un nuevo coronavirus denominado SARS-CoV-2, agente causal de la epidemia de neumonía atípica COVID-2019, que el 11 de marzo de 2020 fue declarada pandemia por la OMS.Hasta el 30 de septiembre de 2020, en Argentina fueron confirmados 751.001 casos y más de 16.937 muertes.La frecuencia y el impacto de las coinfecciones que afectan a los pacientes infectados por SARS-Cov-2 se ha estudiado junto con el avance de la pandemia. Entre las debidas a hongos se encuentran las fungemias por Candida sp, la aspergilosis invasora, las micosis sistémicas endémicas y la neumocistosis. Presentamos las distintas coinfecciones micosis-COVID-19 que fueron asistidas en nuestra institución entre abril y septiembre de 2020, y se realiza un análisis de las características de estas infecciones en pacientes con y sin sida. En este período se internaron 2837 pacientes, 2287 tuvieron diagnóstico confirmado de COVID-19. La coinfección de COVID-19 con micosis pulmonares o sistémicas fue menor al 1%.Dieciocho pacientes presentaron infecciones fúngicas pulmonares o sistémicas. Ocho padecieron candidemias, cinco criptococosis meningeas, dos histoplasmosis, dos aspergilosis invasoras agudas probables y una aspergilosis pulmonar crónica. La estadía prolongada en terapia intensiva facilitó las fungemias por Candida sp, los casos de histoplasmosis y criptococosis parecen relacionarse con la enfermedad avanzada por VIH y no con COVID-19. Los enfermos con un componente inflamatorio basal alto con neumonía grave por coronavirus se relacionan más con micosis invasoras que los enfermos VIH positivos con niveles bajos de LTCD4+

On December 2019 a new coronavirus (SARS-CoV2) result in atypical pneumonía epidemic, it was identified in Wuhan China and it was called COVID-19. Then on March 11 was declared pandemic by the WHO.Until September 30, 2020 in Argentina 751,001 cases and more than 16,937 deaths have been confirmed. The frequency and impact of co-infections affecting SARS-Cov2 infected patients has been studied with the advance of the pandemic. Among those due to fungi are Candida sp fungemias, invasive aspergillosis, endemic systemic mycoses, and pneumocystosis.We present the different mycosis-COVID-19 co-infections that were assisted in F. J. Muñiz Hospital between April and September of this year and review the characteristics of these infections in patients with and without AIDS is carried out.In this period, 2,837 patients were admitted in the Muñiz hospital, 2,287 had a confirmed diagnosis of COVID-19.Co-infection of COVID-19 with pulmonary or systemic mycoses was less than 1%.Eighteen patients had pulmonary or systemic fungal infections. Eight suffered from candidemia, five meningeal cryptococcosis, two histoplasmosis, two probable acute invasive aspergillosis, and one chronic pulmonary aspergillosis.Prolonged stay in intensive care facilitated fungemia due to Candida sp. Histoplasmosis and cryptococcosis cases seem to be related to advanced HIV disease and not to COVID-19.Patients with a high baseline inflammatory component with severe coronavirus pneumonia are more associated with invasive mycoses than HIV-positive patients with low levels of LTCD4 +

Revisión del impacto del sector ladrillero sobre el ambiente y la salud humana en México / Environmental and human health effects caused by the Mexican bricks factories

Resumen: Objetivo: Describir el trabajo precario en el sector ladrillero de México, sus efectos en salud e intervenciones. Material y métodos: Se realizó una revisión sobre el sector ladrillero, así como su impacto en la salud y los estudios de exposición que se han realizado en México en bases de datos y sitios gubernamentales con restricción de idioma inglés y español. Las palabras claves utilizadas fueron "trabajo precario", "contaminación por ladrilleras", "efectos en salud" e "intervenciones". Resultados: Existen pocos trabajos que señalen la exposición ambiental y biológica en el sector ladrillero del país. Se encontraron diversas intervenciones en el sector para reducir los impactos ambientales y de salud, sin embargo, no se enfocan directamente en el trabajador y sus familias. Conclusión: Las zonas ladrilleras presentan altos niveles de contaminación. Se requiere de información que refleje la exposición a mezclas de sustancias tóxicas en trabajadores, familias y población aledaña a estas zonas.

Abstract: Objective: To describe the precarious conditions of the workers on the Mexican brick sector and their effects on health and possible intervention projects. Materials and methods: A review of databases and government sites (with English and Spanish language restrictions) was carried out to correlate the human health injury caused by the bricks factories' pollution. Exposure and health impact studies carried out in Mexico were analyzed. Keywords corresponding "precarious work", "brick pollution", "health effects" and "interventions" were used in the database search. Results: We found only a few studies that described environmental and biological effects caused by the brick sector in Mexico. Regarding intervention programs published until this year, our analysis indicates that these projects have the aim to reduce the environmental impacts but not ameliorate the health of the brick factories workers and their families. Conclusions: High levels of pollution were described in brick factories' areas. New studies are required to explore the effects of mixtures toxic substances over health workers, his families, and surrounding factories' population.

Cuestionario de impacto afectivo en el dolor crónico de origen benigno: propuesta basada en la revisión del cuestionario de impacto emocional en dolor neuropático / Affective impact questionnaire on chronic pain of benign origin: proposal based on the review of the emotional impact questionnaire on neuropathic pain

El objetivo principal del presente trabajo es construir un instrumento que permita el screening afectivo en la experiencia dolorosa, útil para todo profesional de la salud que trabaje con pacientes con dolor, quedando la invitación a usarlo en la clínica para evaluar su eficacia. Basado en el Cuestionario de Impacto Emocional en Dolor Neuropático (CIE-6), recomendado por la ACHED-CP, de la autoría del psicólogo Eduardo Muñoz. Se realizó una revisión teórica y desde la evidencia de los factores afectivos que participan en la experiencia dolorosa. A partir de lo anterior, se propone un rediseño del CIE-6. Consiste, primero en la eliminación de tres ítems de insomnio, cansancio y limitación del original, ya que apuntan a costos sanitarios y discapacidad, siendo reemplazados por estados afectivos como ansiedad, desesperanza, injusticia e incontrolabilidad.

The main objective of this work is to build an instrument that allows the affective screening in the painful experience, and be useful for every health care professional working with patients with pain, encouranging profesionals to use it in the clinic to evaluate its effectiveness. It ́s based on the Questionnaire of Emotional Impact on Neuropathic Pain recommended by the ACHED-CP of the authorship of the psychologist Eduardo Muñoz. A theoric review was conducted and from the evidence of the affective factors involved in the painful experience. As it was mentioned before, a redesign of the CIE-6 was proposed. It consists, first of all, of the elimination of three items of insomnia, tiredness and limitation from the original, since they point out to health costs and disability, being replaced by affective states such as anxiety, hopelessness, injustice and uncontrollability.

First record of Ornithonyssus bursa (Berlese, 1888) (Mesostigmata: Macronyssidae) parasitizing invasive monk parakeets in Santiago, Chile / Primeiro registro de Ornithonyssus bursa (Berlese, 1888) (Mesostigmata: Macronyssidae) parasitando caturritas invasoras em Santiago, Chile

Abstract Myiopsitta monachus is an invasive psittacine with wide distribution due to the pet trade. Its large communal nests and synanthropic nature contribute to its successful colonization of cities, from where it seems to be expanding in range and numbers. This is relevant with regard to pathogens that invasive species may harbor, especially when host populations thrive. We aimed to identify an abundant mite found in invasive monk parakeet chicks that had been collected in Santiago during 2017 and 2018. Through morphological and molecular identification of the 18S ribosomal RNA gene, we confirmed the presence of Ornithonyssus bursa. This was the first report of this mite in Chile. This mite is common in native and invasive monk parakeet populations and may affect other birds, including domestic fowl. Further, this mite bites people and can be a potential vector of pathogens such as bacteria or viruses. We conclude that this parasite was likely introduced with the parakeet and discuss possible ecological, health and economic consequences of this new potential pest.

Resumo Myiopsitta monachus é um psitacídeo invasor amplamente distribuído devido ao tráfico de animais selvagens. Os grandes ninhos comunitários construídos e sua condição de espécies sinantrópicas contribuem para a colonização bem-sucedida das cidades, onde parece estar expandindo sua distribuição e número de indivíduos. Isso é relevante, quando se trata de patógenos que os invasores podem abrigar, especialmente quando as populações hospedeiras prosperam. O objetivo deste trabalho foi identificar um ácaro abundante, encontrado em filhotes de periquitos-monge introduzidos em Santiago, Chile, coletados durante 2017 e 2018. Por meio da identificação morfológica e molecular do gene do RNA ribossômico 18S, foi confirmada a presença de Ornithonyssus bursa, sendo o primeiro registro para o Chile. Esse ácaro é comum em populações nativas e introduzidas de periquitos-monge e pode afetar outras aves, incluindo aves domésticas. Além disso, esse ácaro pode picar pessoas e pode ser um potencial vetor de patógenos, como bactérias ou vírus. Conclui-se que esse parasita provavelmente foi introduzido com o periquito e foram discutidas as possíveis consequências ecológicas de saúde e econômicas dessa nova praga em potencial.

Internal consistency and confirmatory validity of the parenting practices inventory in a Mexican population sample / Consistencia interna y validez confirmatoria del inventario de prácticas de crianza en una muestra de población mexicana

Abstract Introduction Parenting practices refer to specific behaviours used by parents and caretakers of children to guide childhood development and socialization goals. These practices are associated with children's health, psychological, and physical development. Objective To determine the psychometric properties of the Parenting Practices Inventory (PPI) among a group of child caregivers in Mexico City. Method The PPI was applied to 443 caregivers of children and adolescents, who attended a general health care centre in Mexico City. For the psychometric evaluation of the instrument, the full distribution and discrimination of the items was analysed first. Then, the validity of the construct was tested through an exploratory factor analysis and a confirmatory analysis with structural equation modelling. Results The internal consistency of the PPI showed α = .867 and 41.25% of variance explained for all four dimensions of interest. The confirmatory factor analysis showed that the model had goodness of fit. It included twenty-four items with adequate consistency and validity indices. Discussion and conclusion The PPI is therefore a potentially useful psychometric measure for evaluating parenting practices among this type of population and could have major implications for the development of interventions and preventive programmes. It provides scientific bases for diagnostic decision-making and primary health care from the moment of initial contact to specialized medical care.

Resumen Introducción Las prácticas de crianza se refieren a comportamientos específicos utilizados por los padres y cuidadores de niños para guiar su desarrollo y metas de socialización infantil. Estas prácticas están asociadas con la salud, el desarrollo psicológico y físico de los niños. Objetivo Determinar las propiedades psicométricas del Inventario de Prácticas de Crianza (IPC) entre un grupo de cuidadores de niños en la Ciudad de México. Método El IPC se aplicó a 443 cuidadores de niños y adolescentes, que asistieron a consulta médica general en un Centro de salud en la Ciudad de México. Para la evaluación psicométrica del instrumento se analizó la distribución total y la discriminación de los reactivos. La validez de constructo se probó a través de análisis factorial exploratorio y análisis confirmatorio con modelos de ecuaciones estructurales. Resultados El IPC mostró α = .867 y 41.25% de la varianza explicada para las cuatro dimensiones de interés. El análisis factorial confirmatorio mostró que el modelo tuvo buena bondad de ajuste. Incluyó veinticuatro ítems con una consistencia e índices de validez adecuados. Discusión y conclusión El IPC es una medida psicométrica potencialmente útil para evaluar las prácticas de crianza en esta población y podría tener implicaciones importantes para el desarrollo de intervenciones y programas preventivos. Esto brinda bases científicas para la toma de decisiones en la atención primaria de la salud desde el momento del contacto inicial hasta la atención médica especializada en caso de ser requerida.

Neumonía grave en la comunidad: ¿cuándo pensar en SAMR-AC? / Severe community pneumonia: when to think about CA-MRSA

ntroducción: Aunque la incidencia de neumonía adquirida en la comunidad (NAC) por Staphylococcus aureus meticilino-resistente adquirido en la comunidad (SAMR-AC) es inferior al 10%, por su elevada mortalidad debe considerarse en los pacientes graves.Objetivo: Identificar factores de riesgo asociados con SAMR-AC en pacientes con NAC grave. Material y métodos: Estudio observacional, retrospectivo, que analizó pacientes con NAC con diagnóstico etiológico ingresados en terapia intensiva en un hospital público entre 2006 y 2017.Resultados: Se incluyeron 250 episodios de NAC, 53 por SAMR-AC y 197 por otros agentes. Los pacientes con SAMR fueron más jóvenes (35,6±13,4 vs 43,1±12,4, p<0,001) y mostraron mayores tasas de infecciones de piel y estructuras relacionadas (IPER) (58,4% vs 2,0%, p<0,001), empiema (15,9% vs 5,0%, p=0,006), compromiso radiológico bilateral (81,1% vs 36,0%, p<0,001), promedio de score APACHE II basal (16,7±3,8 vs 13,2±4,3, p<0,001) y requerimiento de ventilación mecánica (VM) (33,9 vs 17,6 p=0,009). La tasa de mortalidad fue significativamente mayor para los pacientes con SAMR-AC (35,8% vs 11,1%, p<0,001). Las variables que se asociaron con SAMR-AC fueron IPER (OR 67,99, IC 5% 21,94-210,65), compromiso radiológico bilateral (OR 7,63, IC 95% 3,67-16,11), scoreAPACHE II ≥ 15 (OR 4,37, IC 95% 2,08-9,16), edad ≤ 35 años RESUMENTRABAJO COMPLETO(OR 3,60, IC 95% 1,77-7,29), empiema (OR 3,32, IC 95% 1,24-8,10) y VM (OR 2,85, IC 95% 1,36-5,86). Conclusión: En pacientes con NAC grave, la presencia de IPER, compromiso radiológico bilateral, score APACHE II ≥ 15, edad ≤ 35 años, empiema y VM se asociaron significativamente con mayor probabilidad de infección por SAMR-AC

ntroduction: Despite the incidence of community-acquired pneumonia (CAP) due to community acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) being less than 10%, its presence should be considered in critical patients because of its high rate of mortality.Objectives: To identify risk factors associated with CA-MRSA in patients with severe CAP.Materials and method: A retrospective, observational study analysed episodes of etiological diagnosis in patients admitted in Intensive Care Unit in a public hospital between 2006 and 2017.Results: 250 episodes of NAC were included, among which 53 were caused by SAMR-AC and 197 by other agents. Patients with MRSA were the youngest (35.6±13.4 vs 43.1±12.4, p<0.001), and showed higher rates of skin and skin-structure infections (SSSI) (58.4% vs 2.0%, p<0.001), empyema (15.9% vs 5.0%, p=0.006), bilateral radiological compromise (81.1% vs 36.0%, p<0.001), average base-line APACHE II score (16.7±3.8 vs 13.2±4.3, p<0.001) and mechanical ventilation requirement rate (MV) (33.9 vs 17.6 p=0.009). The mortality rate was significantly higher than the one in CA-MRSA patients (35.8% vs 11.1%, p<0.001). The variables associated with CA-MRSA were SSSI (OR 67.99, IC 5% 21.94-210.65), bilateral radiological compromise (OR 7.63, IC 95% 3.67-16.11), APACHE II score ≥ 15 (OR 4.37, IC 95% 2.08-9.16), age ≤35 years (OR 3.60, IC 95% 1.77-7,29), empyema (OR 3.32, IC 95% 1.24-8.10) and MV (OR 2.85, IC 95% 1.36-5.86).Conclusion: The presence of SSSI, bilateral radiological compromise, APACHE II score ≥ 15, age ≤35 years, empyema and MV in patients with severe CAP was largely associated with higher probability of CA-MRSA infection

Polimorfismos de un solo nucleótido representativos para los alelos clásicos del antígeno leucocitario humano en familias antioqueñas con diabetes mellitus tipo 1 / Classical HLA alleles tag SNP in families from Antioquia with type 1 diabetes mellitus

Resumen Introducción. La región del antígeno leucocitario humano (Human Leukocyte Antigen, HLA) se ha asociado claramente con enfermedades autoinmunitarias, como la diabetes mellitus de tipo 1. Los polimorfismos representativos de un solo nucleótido (tag Single Nucleotide Polymorphism, tag SNP) constituyen una forma alternativa de evaluar los alelos clásicos del HLA. En la población europea se ha reportado un grupo de tag SNP para múltiples alelos clásicos relacionados con la predisposición o la resistencia frente a dicha enfermedad. Objetivo. Validar la metodología basada en los tag SNP enfocada en la inferencia de alelos HLA clásicos, y evaluar su asociación con la diabetes mellitus de tipo 1 en una muestra de familias antioqueñas. Materiales y métodos. Se estudió una muestra de 200 familias antioqueñas con uno a dos hijos afectados por diabetes mellitus de tipo 1. Se genotipificaron 13 SNP mediante el ARMS-PCR (Amplification Refractory Mutation System-Polymerase Chain Reaction) con cuatro iniciadores, o mediante la PCR-RFLP (PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism). Además, se evaluó la validez de los tag SNP de 1.000 genomas reportados en europeos en una muestra de 60 individuos de la población colombiana de Medellín. Se hicieron las pruebas de desequilibrio de la transmisión, de desequilibrio de ligamiento y de equilibrio de Hardy-Weinberg. Resultados. En la población de estudio no se encontró suficiente desequilibrio de ligamiento entre los SNP y los alelos clásicos evaluados, por lo cual no fue posible inferir los alelos clásicos del HLA para el conjunto de familias con diabetes mellitus de tipo 1. El estudio de asociación evidenció que esta región aporta factores tanto de riesgo como de protección para el desarrollo de la enfermedad. Los tag SNP apropiados para la muestra de estudio se determinaron usando los SNP ubicados en la región HLA en la base de datos del 1000 Genomes Project en la mencionada población. Conclusiones. Los patrones de desequilibrio de ligamiento en la población estudiada fueron diferentes a los reportados para la población europea. A pesar de esto, se encontró evidencia clara sobre el papel de la región HLA en el riesgo de padecer diabetes mellitus de tipo 1 en la población de estudio.

abstract Introduction: The HLA region strongly associates with autoimmune diseases, such as type 1 diabetes. An alternative way to test classical HLA alleles is by using tag SNP. A set of tag SNP for several classical HLA alleles has been reported as associated with susceptibility or resistance to this disease in Europeans. Objective: We aimed at validating the methodology based on tag SNP focused on the inference of classical HLA alleles, and at evaluating their association with type 1 diabetes mellitus in a sample of 200 families from Antioquia. Materials and methods: We studied a sample of 200 families from Antioquia. Each family had one or two children with T1D. We genotyped 13 SNPs using tetra-primer ARMS-PCR or PCRRFLP. In addition, we tested the validity of the tag SNP reported for Europeans in 60 individuals from a population of Colombians living in Medellín (CLM) from the 1000 Genomes Project database. Statistical analyses included the Hardy-Weinberg equilibrium, the transmission disequilibrium and the linkage disequilibrium tests. Results: The linkage disequilibrium was low in reported tag SNP and classical HLA alleles in this CLM population. Association analyses revealed both risk and protection factors to develop type 1 diabetes mellitus. Appropriate tag SNPs for the CLM population were determined by using the genotype information available in the 1000 Genome Project database. Conclusions: Although linkage disequilibrium patterns in this CLM population were different from those reported in Europeans, we did find strong evidence of the role of HLA in the development of type 1 diabetes mellitus in the study population.

Complejidad de la expresión de genes asociados a obesidad en el tejido adiposo humano / Complexity of the expression of genes associated with obesity in human adipose tissue / Complexidade da expressão de genes associados à obesidade no tecido adiposo humano

Resumen Objetivo: Analizar la complejidad de la expresión génica en tejido adiposo de genes asociados con obesidad, mediante simulación computacional con diferentes herramientas bioinformáticas. Métodos: Después de una búsqueda bibliográfica en PubMed, se seleccionaron 37 genes asociados con obesidad con fold change mayor a 1,5. A partir del cálculo de valores de los z-score obtenidos de experimentos de micromatrices de ADN de muestras de tejido adiposo de personas obesas y de control, se construyó una red de interacción con el programa Cytoscape 3.2. La información detallada sobre las características genómicas de estos genes se extrajo de las bases de datos Genome Browser de la UCSC y del NCBI. Utilizando herramientas de análisis de multivariado, se hizo un análisis de componentes principales y uno de agrupación. Resultados: La red construida mostró que los genes con mayor número de interacciones fueron: 1) el factor nuclear respiratorio (NRF1), 2) el canal activado de potasio activado por calcio alfa 1 (KCNMA1) y 3) la sintasa de ácidos grasos (FASN). Los que tuvieron mayores valores de expresión fueron: 1) el factor de crecimiento endotelial vascular A (VEGFA), 2) la dioxigenasa dependiente de alfa-cetoglutarato (FTO) y 3) el regulador de crecimiento neuronal 1 (NEGR1). Las proteínas IL6, BDNF y HLC tuvieron los mayores valores de interacción con IL6R, NRF1 y ACACB, respetivamente. Las categorías ontológicas más importantes se relacionaron con procesos metabólicos de lipoproteínas, el ciclo de los ácidos tricarboxílicos, la activación de las MAP-quinasas y la cascada JNK. Conclusiones: En su conjunto los resultados obtenidos de sobreexpresión diferencial de genes asociados con el metabolismo de lípidos en el tejido adiposo de personas obesas podría ser un criterio para discriminar a nivel de diagnóstico esta patología.

Summary Objective: To analyze the complexity of gene expression in the adipose tissue of genes associated with obesity, by computer simulation with different bioinformatics tools. Methods: After conducting a PubMed literature search, 37 genes associated with obesity with a fold change greater than 1.5 were selected. An interaction network was cons tructed using the Cytoscape 3.2 program from the calculation of z-score values obtained from DNA microarray experiments of adipose tissue samples collected from obese and control people. Detailed information on the genomic characteristics of these genes was extracted from the UCSC and NCBI Genome Browser databases. Using multivariate analysis tools, a principal component analysis and a cluster analysis were carried out. Results: The constructed network showed that the genes with the greatest number of interactions were: 1) the nuclear respiratory factor (NRF1), 2) the activated channel of potassium activate by calcium alpha 1 (KCNMA1), and 3) the fatty acid synthase (FASN). Those with the higher expression values were: 1) vascular endothelial growth factor A (VEGFA), 2) alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase (FTO), and 3) neuronal growth regulator 1 (NEGR1). The IL6, BDNF and HLC proteins had the highest interaction values with IL6R, NRF1 and ACACB, respectively. The most important ontological categories were related to lipoprotein metabolic processes, the tricarboxylic acid cycle, the activation of the MAP kinases, and the JNK cascade. Conclusions: As a whole, the results obtained from differential overexpression of genes associated with lipid metabolism in the adipose tissue of obese people could be a criterion to discriminate this pathology at a diagnostic level.

Resumo Objetivo: Analisar a complexidade da expressão gênica no tecido adiposo de genes associados com obesidade, por meio de simulação por computador com diferentes ferramentas bioinformáticas. Métodos: Após uma busca bibliográfica em PubMed, foram selecionados 37 genes associados com obesidade com fold change superior a 1,5. A partir do cálculo de valores dos z-score obtidos de experimentos de micro matrizes de ADN de amostras de tecido adiposo de pessoas obesas e de controle, construiu-se uma rede de interação com o programa Cytoscape 3.2. A informação detalhada sobre as características genômicas destes genes foi obtida das bases de dados Genome Browser da UCSC e do NCBI. Utilizando ferramentas de análise de multivariado, fez-se uma análise de componentes principais e um de agrupação. Resultados: A rede construída mostrou que os genes com maior número de interações foram: 1) o fator nuclear respiratório (NRF1), 2) o canal ativado de potássio ativado por cálcio alfa 1 (KCNMA1) e 3) ácido graxo sintase (FASN). Os que tiveram maiores valores de expressão foram: 1) o fator de crescimento endo-telial vascular A (VEGFA), 2) a dioxigenase dependente de alfa-cetoglutarato (FTO) e 3) o regulador de crescimento neuronal 1 (NEGR1). As proteínas IL6, BDNF e HLC tiveram os maiores valores de interação com IL6R, NRF1 e ACACB, respectivamente. As categorias ontológicas mais importantes se relacionaram com processos metabólicos de lipoproteínas, o ciclo dos ácidos tri carboxílicos, a ativação das MAP-quinases e a cascata JNK. Conclusões: Em seu conjunto, os resultados obtidos de superexpressão diferencial de genes associados com o metabolismo de lipídios no tecido adiposo de pessoas obesas poderia ser um critério para discriminar a nível de diagnóstico esta patologia.